Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vav1P27870 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vav1P27870 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms