Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CftrP26361 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CftrP26361 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CftrP26361 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CftrP26361 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CftrP26361 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CftrP26361 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CftrP26361 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CftrP26361 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CftrP26361 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CftrP26361 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CftrP26361 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CftrP26361 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CftrP26361 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CftrP26361 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CftrP26361 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms