Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra3P26049 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra3P26049 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra3P26049 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra3P26049 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms