Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd1P25322 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd1P25322 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms