Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms