Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gria1P23818 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms