Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrhrP21761 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrhrP21761 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms