Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TP20293 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TP20293 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TP20293 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TP20293 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TP20293 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TP20293 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TP20293 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TP20293 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TP20293 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms