Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms