Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms