Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms