Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prf1P10820 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms