Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm3P0DP28 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms