Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf2P09926 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms