Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf1P09925 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf1P09925 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms