Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApoeP08226 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApoeP08226 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApoeP08226 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ApoeP08226 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ApoeP08226 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApoeP08226 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApoeP08226 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ApoeP08226 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms