Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01740 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01740 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01740 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01740 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01740 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01740 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01740 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01740 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01740 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms