Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01679 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01679 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01679 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01679 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01679 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01679 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01679 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01679 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01679 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01679 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms