Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01641 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01641 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01641 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01641 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01641 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms