Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnb1P01575 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms