Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl2O89104 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sypl2O89104 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms