Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
F11rO88792 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms