Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms