Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cfdp1O88271 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cfdp1O88271 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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