Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp4O70480 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp4O70480 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms