Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxq1O70220 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Foxq1O70220 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxq1O70220 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxq1O70220 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxq1O70220 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxq1O70220 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxq1O70220 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxq1O70220 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxq1O70220 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxq1O70220 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxq1O70220 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxq1O70220 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxq1O70220 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxq1O70220 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxq1O70220 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxq1O70220 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxq1O70220 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxq1O70220 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Foxq1O70220 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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