Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms