Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SlkO54988 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SlkO54988 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlkO54988 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlkO54988 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlkO54988 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SlkO54988 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SlkO54988 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SlkO54988 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SlkO54988 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms