Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn5O54942 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn5O54942 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms