Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms