Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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