Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms