Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaxO35602 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaxO35602 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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