Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema6aO35464 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms