Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xbp1O35426 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms