Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms