Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms