Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d1bO35324 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d1bO35324 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms