Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms