Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcm2O09102 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm2O09102 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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