Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms