Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn5O08688 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn5O08688 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms