Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlyrefO08583 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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