Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms