Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2056J3QQ02 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms