Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smim22J3QP37 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smim22J3QP37 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim22J3QP37 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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