Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc180J3QNE4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc180J3QNE4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms