Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700014D04RikJ3QMS2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms