Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms