Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20830J3KML6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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